hkaneのLab Notebook

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2017年3月8日水曜日

GATKのエラー(2)

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GATKでいつも問題になってしまうのが、 read group fields です。 詳しい説明は以下のページを参照していただければと思います。 https://software.broadinstitute.org/gatk/guide/article?id=6472 ...
2016年12月25日日曜日

リファレンスゲノムのバージョン変換 - イネ編

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イネのデータベースのリファレンスゲノムがIRGSP build 4あるいは IRGSP   build 5になっている場合には、今使っている リファレンスゲノムIRGSP1.0に変換する必要があります Samtoolsを使うと簡単!FASTAファイルから部分配列...
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自己紹介

hkane
某大学の特任助教です。間違ったことを書いてしまうかもしれないので、参考程度にしていただければ幸いです。
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