Mapchart 2.30の使い方-データ準備編

Mapchart 2.30のインストールについては、インストール編をご利用ください。

MapChartの書式はMapChart example 4のファイルをを参考にすると使いやすいです。

• 連鎖地図の書式

group B

TG608    0

TG189    2

CT63B   21

TG1B    33

TG234   41

TG14    51

CT24   124

一行目のgroup Bは染色体や連鎖群の名前などを記入します

1列目：マーカー

2列目：位置(遺伝距離)

• マーカーの書式

group A

C1    0.0 C1

C2    2.0 C2

C3    22.1 C3

C4    29.1 C4

C5    30.9 C5

C6      47.9 C6

C7    50.3 C7

C8     61.0 C8

C9     74.2 C9

C10      94.2 C10

C11    105.2 C11

1列目：マーカー

2列目：位置(遺伝距離)

3列目：書式設定

3列目の書式設定は、例えば

B:bold

I:italic

C2:color code 2

です。color codeは数字を変えると色が変更になります。

• QTL intervalsの書式

qtls ;start of qtls section of linkage group A　

Ca-14 1.3 7.9 12.3 18.6

      ;first QTL: name Ca-14

      ;           start of outer (1.3) and inner (7.9) intervals,

      ;           end of inner (12.3) and outer (18.6) intervals,

      ;           no formatting, displayed with default color (C1),

      ;           default fill and line style (solid) and default font style

Ca-14はQTLの名前

1.3 7.9 12.3 18.6はQTLの位置を示します。

   

vg-1 73.0 73.0 85.0 85.0  C3 F4　

start of outer intervalとinner intervalを同じにすれば線なし

     ;third QTL: only inner interval shown, since it overlaps outer interval (73.0 - 85.0)

     ;           color number 3 (C3),　四角の色の変更　デフォルトは黒

     ;           fill style F4 (diagonal hatch)　模様を変更可能

     ;the first, second and third QTLs don't overlap each other and are shown in the same

     ;"QTL band" (in the same vertical line)