2013年6月22日土曜日

TodoDBからデータをダウンロード


TogoDBではデータを検索で絞り込み、ダウンロードすることができます



Simple Search の[Download]ボタンや Advanced Search の[Download]ボタンをクリ ックすると、データベースのデータを CSV 形式でダウンロードすることができます。

ダウンロードされるCSVファイルの名前は、デフォルトでは "データベース名.csv" となります。


取得したデータをExcelで開こうとしたとき、データにずれが生じたことがありました。
テキストファイルで開くと問題ないのですが 、Excelで開こうとすると変なところで改行が入ってしまいました。

原因をお聞きしたところ…


改行が入った行には文字数の多いセルがあり、Excelのセル当たりの文字数制限 (Excel2010では32767文字)を超えた辺りでExcelが行を分けてしまったようです。

このようなセル当たりの文字数制限を超えるデータの場合はExcelで扱うのは避けた方が良さそうです
(そんなデータをExcelで開こうとする事に問題がありますが...)

http://dbarchive.biosciencedbc.jp/files/togodb_user.pdf

2013年6月13日木曜日

TogoDB ~fileのアップロード

TogoDBでデータベースを公開するためには、Excelなどを利用してcsvファイルを準備します。


Importボタンから

Database nameを入力


Upload fileでファイルを選択

これで完了です。
しかしmacでファイルを作成した場合下記のようなエラーが出ます。


[CSV::IllegalFormatError] CSV::IllegalFormatError

an error has occurred

原因は改行コード問題。
これを解決するために、

MotDB 

AJACS32/bono

に掲載された
こちらを利用します。

perl -pe 's/\r/\n/g' mac.txt > mac_conv_unix.txt

perl -pe 's/\r/\n/g' 元のファイル名 > 新しいファイル名

これでファイルの変換を行い、もう一度

Upload file

を行います。



統合TVの「TogoDBの使い方 〜自分のデータベースを作る〜
はこちらから

2013年6月2日日曜日

TogoDBを使うために... アカウントの作成

TogoDBを開くと次のような画面が出てきます。








赤色のボタンのDataBaseをクリックしてから始めます。
下のようなログイン画面が出てくるので、OpenIDを入力しSign Inします。












TogoDBを利用するためにはDBCLSのOpenIDが必要です。
DBCLS OpenID サービス は、DBCLS が提供する OpenID 認証サービスです。
OpenIDは、一つのIDで対応するWebサービスに認証ができる仕組みです。Op­enID 対応サービスを利用する場合には、各サービス毎にアカウントやユーザ情報を管理する必­要がなくなります。

統合TVによる使い方紹介もあり、簡単にアカウントを作成する事が出来ます。

アカウントを作成してSign Inすると次のような画面が出てきます




これで準備は完了です。
次はデータベース用のデータを準備します。

統合TVの「TogoDBの使い方 〜自分のデータベースを作る〜
はこちらから



TOGO DBってすごい!

 EST 配列を自前の DBで公開したいと考えました。
さて、どうやったら良いか見当もつきません。

そんな時教えていただいたのが TOGO DB です。




この画面を見ただけではどこから始めようか...
当時はTogoDBが出来たばかりということもあり、詳しい事が分かりませんでした。

TogoDBメリットとしては


  1. サーバーが不要。メンテナンスも不要。
  2. csv  形式でデータをアップロード可能。
  3. 検索機能が充実している。
があげられます。
利用申請も必要ありませんでした。
DBCLSのOpenIDの登録だけで使う事ができました。




統合TVの「TogoDBの使い方 〜自分のデータベースを作る〜
はこちらから